產品名稱:DBiT-seq技術微流控芯片夾具
1. 微流控芯片夾具用途:
用于DBiT-seq空間高分辨率的多組學技術微流控芯片進樣。DBiT-seq空間高分辨率的多組學技術作為一種全新的空間高分辨率多組學研究技術,DBiT-seq不受組織新鮮度的限制,有潛力成為繪制一系列分子信息(蛋白質、轉錄組和表觀基因組)的通用方法。其潛在影響將是廣泛和深遠的,有望應用于許多不同領域的基礎和轉化研究,包括胚胎學,神經科學,癌癥和臨床病理學等。
2. DBIT-SEQ技術原理:
DBiT-seq工作流程如圖所示,將含有平行微通道(寬度為10μm、25μm或50μm)的聚二甲基硅氧烷(PDMS)微流控芯片置于組織載玻片上,微流控通道用于將分子條形碼以空間受限的方式傳遞到甲醛固定的組織玻片表面。第一種微流控芯片通道在組織切片表面引入帶有oligo-dT的DNA條形碼A1-A50,可結合組織mRNA并啟動原位逆轉錄形成cDNAs。隨后垂直放入第二種微流控芯片通道,引入第二組標記蛋白的DNA條形碼B1-B50。A1-A50和B1-B50交叉原位連接,產生組織像素的二維拼接,每一個拼接點都包含完整條形碼AiBj的唯一組合(i=1-50, j=1-50)。通過這種巧妙的方法,可以在同一固定的組織切片上同時完成對mRNA、蛋白質,甚至其他多組學物質的條形碼標記,后續通過NGS測序結果分析,得以構建一個高分辨率多組學空間圖譜,使用過后的組織切片還可以進行成像記錄。
另外,DBiT-seq技術不僅可用于新鮮組織切片,還可用于已經固定的標準組織玻片,甚至冰凍的組織切片也可以通過轉移到聚賴氨酸包被的載玻片上,使用甲醛固定,在-80℃保存備用。
圖1 DBiT-seq的工作流程示意圖
注:圖1截取自文獻:Liu et al. (2020) High-Spatial-resolution Multi-Omics Sequencing via Deterministic Barcoding in Tissue. Cell. 若有侵權請聯系刪除。